Вирусное загрязнение объектов окружающей среды, и в первую очередь водных, представляет большую опасность для населения. В силу высокой устойчивости к воздействию физических и химических факторов, вирусы весьма долго выживают в воде и распространяются с водотоком на большие расстояния от источника загрязнения, достигая зон купания, а также пунктов водозабора водопроводных станций. В результате вирусного загрязнения рекреационной и водопроводной воды происходит заражение водопользователей, возникают вспышки кишечных вирусных инфекций, неоднократно описываемых в литературе. Вирусному загрязнению подвержены также подземные водоисточники, а также источники нецентрализованного водоснабжения. В настоящее время известно более 140 видов различных патогенных вирусов циркулирующих в водных системах, включающие вирусы полиомиелита, энтеровирусы Коксаки А, Коксаки В, вирусы ЕСНО, энтеровирусы 68-71 типов; аденовирусы, калицивирусы, атстро-, рео-, рота-, корона-вирусы, вирусы Норфолк, вирусы гепатитов А и Е, мелкие вирусы – родственные аденовирусам, и многие другие. Эти вирусы вызывают не только диареи, а являются причиной самых различных заболеваний, таких как полиомиелитоподобные заболевания, серозный менингит, вирусная пневмония, конъюнктивиты, геморрагические, плевроадениты, миокардиты, гастроэнтериты, энтеральные гепатиты, мышечные миалгии, герпетические ангины, заболевания органов дыхания и пр. Помимо этого, энтеровирусы, являясь мощными аллергенами, вызывают тяжелые аллергические осложнения.

Вирусы характеризуются весьма низкой инфекционной дозой заражения известно, что для развития заболевания достаточно поступления в неимунный организм одной вирусной частицы. Санитарно-вирусологические исследования воды - питьевой, подземных вод, воды источников централизованного водоснабжения, воды нецентрализованного водоснабжения, сточных вод, рекреационных вод - пресных и морских, воды плавательных бассейнов, воды горячего водоснабжения, воды водохранилищ, почвы, смывов с поверхностей с использованием культуральных и молекулярно-биологических методов. Санитарно-вирусологические исследования испытания средств и установок, предназначенных для концентрирования вирусов из воды питьевой воды, подземных вод, воды источников централизованного водоснабжения, воды нецентрализованного водоснабжения, сточных вод, рекреационных вод - пресных и морских, воды плавательных бассейнов, воды горячего водоснабжения, воды водохранилищ. Санитарно-вирусологические исследования испытания средств, установок, водоочистных устройств предназначенных для доочистки и обеззараживания воды в отношении вирусов питьевой воды, подземных вод, воды источников централизованного водоснабжения, воды нецентрализованного водоснабжения, сточных вод, рекреационных вод - пресных и морских, воды плавательных бассейнов, воды горячего водоснабжения, воды водохранилищ, поверхностей. Разработка рекомендаций и мероприятий по снижению циркуляции вирусного загрязнения водных объектов питьевой воды, рекреационных вод, воды источников, воды плавательных бассейнов, и др. и профилактике заболеваемости вирусными инфекциями на изучаемых территориях. Консультация по вопросам методики концентрирования и определения вирусов в воде.

Консультация по вопросам определения колифагов из воды различного вида водопользования. Консультация по вопросам устойчивости различных групп вирусов к воздействию физических, биологических факторов, а также к обеззараживающим агентам и дезинфектантам. Консультация по вопросам вирусного загрязнения воды и разработки рекомендаций и мероприятий по снижению циркуляции вирусного загрязнения водных объектов питьевой воды, рекреационных вод, воды источников, воды плавательных бассейнов, и др. и профилактике заболеваемости вирусными инфекциями на изучаемых территориях. В составе образовательной деятельности Института - проведение научно-практических семинаров 72 часа по повышению квалификации по методам санитарно-вирусологического исследования воды различного вида водопользования, минеральной воды, напитков, поверхностей. 2569-09 «Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности; МУК 4.3.2030-05 "Санитарно-вирусологический контроль эффективности обеззараживания питьевых и сточных вод УФ-облучением»; МУК 4.2.2029-05 «Санитарно-вирусологический контроль водных объектов»; МУ 2.1.4.1184-03 Методические указания по внедрению и применению санитарно-эпидемиологических правил и нормативов Сан Пи Н 2.1.4.1116-02 "Питьевая вода.